FastUMLS: Extracción de conceptos en textos biomédicos

Identificar y extraer cuáles son los conceptos clave relacionados con un texto es un proceso que toma cada mayor importancia en Medicina y en Bilogía Molecular dado el incremento exponencial de información existente en forma de artículos científicos, descripciones de experimentos, y anotaciones a en...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Marina Leonardo, José Luis
Tipo de recurso: tesis de maestría
Fecha de publicación:2009
País:España
Institución:Universidad Complutense de Madrid (UCM)
Repositorio:Docta Complutense
Idioma:español
OAI Identifier:oai:docta.ucm.es:20.500.14352/54567
Acceso en línea:https://hdl.handle.net/20.500.14352/54567
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:004.657:61(043.3)
61:004.657(043.3)
025.4.03(043.3)
Anotación de textos
Extracción de información
Ontologías biomédicas
Minería de textos
UMLS
Text annotation
Information extraction
Biomedical ontologies
Text mining.
Sistemas expertos
Descripción
Sumario:Identificar y extraer cuáles son los conceptos clave relacionados con un texto es un proceso que toma cada mayor importancia en Medicina y en Bilogía Molecular dado el incremento exponencial de información existente en forma de artículos científicos, descripciones de experimentos, y anotaciones a enfermedades, medicamentos y procesos. En este trabajo se muestra una herramienta para la anotación automática de textos con conceptos formales definidos en la Ontología del Metathesaurus del Unified Medical Language System (UMLS). El método propuesto no se basa en el acercamiento tradicional propuesto por las herramientas de Procesamiento de Lenguaje Natural (PLN) sino en la ponderación de los conceptos de acuerdo a las frecuencias de aparición de las palabras buscadas en las definiciones. Se informa de los resultados de diferentes experimentos que comparan los resultados obtenidos con los conceptos ofrecidos por herramientas tradicionales y de pruebas revisadas por investigadores expertos y autores de artículos que han sido procesados por la herramienta. Los resultados demuestran que FastUMLS extrae de forma efectiva conceptos sobre textos biomédicos en tiempos más que razonables. Puede accederse libremente a FastUMLS en la dirección: http://bisaurin.dacya.ucm.es:8283/fastumls