GoTerMinator: Detector de proteínas moonlighting
Hasta ahora las proteinas moonlighting han sido identificadas por métodos experimentales. Este trabajo analiza la posibilidad de crear una herramienta bioinformática capaz de indentificarlas. Partiendo de la información de las bases de datos públicas Gene Ontology y Uniprot, se genera una matriz de...
| Autor: | |
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| Formato: | tesis de maestría |
| Fecha de publicación: | 2022 |
| País: | España |
| Recursos: | Universitat Oberta de Catalunya (UOC) |
| Repositorio: | O2, repositorio institucional de la UOC |
| OAI Identifier: | oai:openaccess.uoc.edu:10609/146509 |
| Acesso em linha: | http://hdl.handle.net/10609/146509 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palavra-chave: | proteinas moonlighting Gene Ontology bioinformática proteïnes moonlighting bioinformàtica protein moonlighting bioinformatics Bioinformatics -- TFM Bioinformàtica -- TFM Bioinformática -- TFM |
| Resumo: | Hasta ahora las proteinas moonlighting han sido identificadas por métodos experimentales. Este trabajo analiza la posibilidad de crear una herramienta bioinformática capaz de indentificarlas. Partiendo de la información de las bases de datos públicas Gene Ontology y Uniprot, se genera una matriz de distancias entre pares de términos GO, a partir de la cual se analiza la posibilidad de agrupar los términos GO según sus funcionalidades, y definir un espacio multidimensional que permita posicionar y medir la distancia entre términos GO. El objetivo final es determinar si las anotaciones GO de una proteína pertenecen a clusters diferentes, y/o si su posición en el espacio dimensional es distante, y por tanto la proteína puede ser moonlighting. Como resultado de este análisis, se han obtenido una serie de agrupaciones de términos GO, mediante diferentes métodos, que se comparan sobre una base de datos de proteínas previamente identificadas como moonlighting, así como sobre proteínas de Uniprot de las que se desconoce su multifuncionalidad. En general, los estudios basados en Gene Ontology comparan las funciones biológicas de distintos genes o proteínas, para estudiar su similaridad. Lo novedoso de GOTerminator es que el objetivo final es encontrar la diferencia biológica dentro de un mismo gen o proteína. |
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