Elucidating catalytic mechanisms of glycoside hydrolases and transferases by means of ab initio molecular dynamics simulations
[spa] Los azúcares presentan una gran variabilidad estructural que es aprovechada por los diferentes organismos para realizar una multitud de procesos biológicos, que incluyen el almacenamiento de energía, el reconocimiento y la señalización celular. Las glicosil hidrolasas y glicosil transferasas s...
| Author: | |
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| Format: | doctoral thesis |
| Status: | Published version |
| Publication Date: | 2014 |
| Country: | España |
| Institution: | Universidad de Barcelona |
| Repository: | Dipòsit Digital de la UB |
| OAI Identifier: | oai:diposit.ub.edu:2445/59333 |
| Online Access: | https://hdl.handle.net/2445/59333 http://hdl.handle.net/10803/283551 |
| Access Level: | Open access |
| Keyword: | Glúcids Catàlisi Dinàmica molecular Enzims Glucides Catalysis Molecular dynamics Enzymes |
| Summary: | [spa] Los azúcares presentan una gran variabilidad estructural que es aprovechada por los diferentes organismos para realizar una multitud de procesos biológicos, que incluyen el almacenamiento de energía, el reconocimiento y la señalización celular. Las glicosil hidrolasas y glicosil transferasas son las enzimas responsables de la hidrólisis y síntesis, respectivamente, de estos biopolímeros y por lo tanto están presentes en una gran variedad de procesos celulares. Las técnicas de modelado molecular permiten analizar estos procesos biológicos, como por ejemplo la reacción de formación de un enlace entre azúcares, a un nivel atomístico. De esta forma, se pueden describir los cambios conformacionales que se producen en el sustrato al unirse a la enzima, identificar el estado de transición de la reacción química y determinar otros aspectos fundamentales de la catálisis enzimática. |
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