High-throughput analysis of the Trypanosoma cruzi minicirculome (mcDNA) unveils structural variation and functional diversity

Trypanosoma cruzi causa la enfermedad de Chagas y tiene un genoma extranuclear único encerrado en una estructura llamada cinetoplasto, que contiene genomas circulares conocidos como maxi y minicírculos. Si bien la estructura y función de los maxicírculos se comprenden bien, aún quedan muchos aspecto...

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Detalhes bibliográficos
Autores: Gómez-Palacio, Andrés, Pita, Sebastián, Cruz-Saavedra, Lissa, Van den Broeck, Frederik, Geerts, Manon, Vallejo, Gustavo A., Carranza, Julio C., Ramírez, Juan David
Tipo de documento: artigo
Estado:Versão publicada
Data de publicação:2024
País:Colombia
Recursos:Universidad del Rosario
Repositório:Repositorio EdocUR - U. Rosario
Idioma:inglês
OAI Identifier:oai:repository.urosario.edu.co:10336/42910
Acesso em linha:https://doi.org/10.1038/s41598-024-56076-4
https://repository.urosario.edu.co/handle/10336/42910
Access Level:Acceso aberto
Palavra-chave:Trypanosoma cruzi
Maxicírculos
Minicírculos
ADNk
ARN guía
Colombia
Enfermedad de Chagas
Maxicircles
Minicircles
kDNA
Guide RNA
Chagas disease
Descrição
Resumo:Trypanosoma cruzi causa la enfermedad de Chagas y tiene un genoma extranuclear único encerrado en una estructura llamada cinetoplasto, que contiene genomas circulares conocidos como maxi y minicírculos. Si bien la estructura y función de los maxicírculos se comprenden bien, aún quedan muchos aspectos de los minicírculos por descubrir. Aquí, realizamos un análisis de alto rendimiento del minicirculoma (mcDNA) en 50 clones aislados de las diversas poblaciones de T. cruzi I de Colombia. Los resultados indican que el mcDNA comprende cuatro subpoblaciones diversas con diferentes estructuras, longitudes y números de regiones semiconservadas (anteriormente denominadas regiones ultraconservadas mHCV) e hipervariables (mHVP) intercaladas. El análisis de la ascendencia del mcDNA y la diferenciación entre clones indica que el mestizaje de clases de secuencias de minicírculos se realiza a lo largo de diversas cepas y huéspedes. Estos resultados respaldan la evidencia de la dinámica multiclonal y la segregación biparental aleatoria. Finalmente, divulgamos el repertorio de ARN guía codificado por mcDNA a escala clonal, y se discuten varios atributos de su abundancia y función.