Whole genome sequencing of the pirarucu (arapaima gigas) supports independent emergence of major teleost clades

Ricardo Assunção Vialle; Edivaldo Herculano Corrêa de Oliveira; Igor Guerreiro Hamoy; Paulo Pimentel Assumpção; Ândrea Ribeiro-dos-santos; João Paulo Matos Santos Lima; Héctor n Seuánez; Sandro José de Souza; Sidney Santos; Jorge Estefano Santana de Souza; Katia de Paiva Lopes; Diego Gomes Teixeira; Pitágoras de Azevedo Alves Sobrinho; André m Ribeiro-dos-santos; Carolina Furtado; Tetsu Sakamoto; Fábio Augusto Oliveira Silva

Whole genome sequencing of the pirarucu (arapaima gigas) supports independent emergence of major teleost clades

O Pirarucu (Arapaima gigas) é um dos maiores peixes de água doce do mundo e membro da superordem Osteoglossomorpha (bonytongues), uma das mais antigas linhagens de peixes raiados. Esta espécie é um respirador aéreo obrigatório encontrado na bacia do rio Amazonas com um potencial atrativo para a aqui...

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Detalhes bibliográficos
Autores:	Ricardo Assunção Vialle, Edivaldo Herculano Corrêa de Oliveira, Igor Guerreiro Hamoy, Paulo Pimentel Assumpção, Ândrea Ribeiro-dos-santos, João Paulo Matos Santos Lima, Héctor n Seuánez, Sandro José de Souza, Sidney Santos, Jorge Estefano Santana de Souza, Katia de Paiva Lopes, Diego Gomes Teixeira, Pitágoras de Azevedo Alves Sobrinho, André m Ribeiro-dos-santos, Carolina Furtado, Tetsu Sakamoto, Fábio Augusto Oliveira Silva
Formato:	artículo
Estado:	Versión publicada
Fecha de publicación:	2018
País:	Brasil
Recursos:	Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)
Repositorio:	Repositório Institucional da UFMG
Idioma:	inglés
OAI Identifier:	oai:repositorio.ufmg.br:1843/39532
Acesso em linha:	http://hdl.handle.net/1843/39532
Access Level:	acceso abierto
Palavra-chave:	Arapaima gigas Pirarucu Osteoglossomorpha Teleostei genome sequencing phylogenomics Sequenciamento de genoma Filogenia

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description	O Pirarucu (Arapaima gigas) é um dos maiores peixes de água doce do mundo e membro da superordem Osteoglossomorpha (bonytongues), uma das mais antigas linhagens de peixes raiados. Esta espécie é um respirador aéreo obrigatório encontrado na bacia do rio Amazonas com um potencial atrativo para a aquicultura. Sua posição filogenética entre os peixes ósseos torna o Pirarucu um assunto relevante para estudos evolutivos da diversificação dos primeiros teleósteos. Aqui nós apresentar, pela primeira vez, uma versão preliminar do genoma do A. gigas, fornecendo informações úteis para e estudos evolutivos. O genoma de A. gigas foi montado com leituras brutas de 103 Gb sequenciadas em uma plataforma Illumina. O projeto final de montagem do genoma foi de 661 Mb, com um contig N50 igual a 51,23 kb e scaffold N50 de 668 kb. Repita sequências representaram 21,69% de todo o genoma, e um total de 24.655 genes codificadores de proteínas foram previstos a partir de a montagem do genoma, com uma média de nove éxons por gene. A análise filogenômica baseada em 24 espécies de peixes apoiou a postulação de que Osteoglossomorpha e Elopomorpha (enguias, tarpons e bonefishes) são grupos irmãos, ambos formando uma linhagem irmã em relação a Clupeocephala (teleósteos restantes). As estimativas de tempo de divergência sugeriram que As linhagens Osteoglossomorpha e Elopomorpha surgiram independentemente em um período de 30 Myr no Jurássico. O rascunho genoma de A. gigas fornece um valioso recurso genético para futuras investigações de estudos evolutivos e também pode oferecer um dado valioso para aplicações econômicas.
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